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基因挖掘来了!实战转录组基因数据分析 数据分析在生命科学与医学领域的最前沿实践

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admin 发表于 2020-7-29 17:19:59 | 显示全部楼层 |阅读模式 打印 上一主题 下一主题
基因挖掘来了!实战转录组基因数据分析 数据分析在生命科学与医学领域的最前沿实践
转录组基因数据分析是一个非常前卫的IT技术分支,但通过这次的课程,同学们对转录组基因数据分析将不再陌生。转录组数据分析一般分为所有基因挖掘、差异基因挖掘、表达量挖掘、高级工具挖掘四个步骤,在本次的课程中我们不仅要对转录组进行数据分析和挖掘,还对转录组技术理论进行了非常深入的研究和探讨,更进一步的进行了数据的可视化分析报告,这对于更好的理解以及转录组数据分析有更实际的应用。

===============课程目录===============

(1)\01、转录组基础
├─01、转录组基础(上).mp4
├─02、转录组基础(下).mp4
├─11-转录组概述(1).pdf
├─11-转录组概述.pdf
(2)\02、Windows下转录组分析软件的安装
├─01、Windows下转录组分析软件安装.mp4
├─02、Windows软件安装-510.mp4
├─转录组数据分析软件安装-Windows.zip
(3)\03、Linux下的软件安装和一键配置转录组运行环境
├─01、Linux下软件安装和一键配置转录组运行环境.mp4
├─02、Linux下软件安装-510.mp4
├─13-1-转录组软件安装-Linux(1).pdf
├─13-1-转录组软件安装-Linux.pdf
(4)\04、转录组Salmon分析流程讲解
├─01、Salmon基础.mp4
├─02、Salmon实战操作.mp4
├─03、Salmon理论-510.mp4
├─04、Salmon实战-510.mp4
├─12-转录组分析流程Salmon(1).pdf
├─12-转录组分析流程Salmon.pdf
├─13_salmon_deseq2_go.zip
├─transcriptome_server.zip
(5)\05、DESeq2差异基因分析理论和操作
├─01、DESeq2差异基因分析理论和操作1.mp4
├─02、DESeq2理论-510.mp4
├─03、DESeq2差异基因分析理论和操作2.mp4
├─04、DESeq2实战-510.mp4
├─14-差异基因分析理论和实战(1).pdf
├─14-差异基因分析理论和实战.pdf
(6)\06、GO、KEGG富集分析理论和可视化讲解
├─01、GO KEGG富集分析理论和可视化讲解.mp4
├─02、GO KEGG msigdb富集分析和可视化实战.mp4
├─03、GO富集理论-510.mp4
├─04、GO富集操作+Cytoscape_clueGO-510.mp4
├─15_16-GOGSEA富集分析原理和操作(1).pdf
├─15_16-GOGSEA富集分析原理和操作.pdf
├─goeast.txt
(7)\07、利用Cytoscape-clueGO进行富集分析
├─01、Cytoscape富集可视化Pathway通路映射.mp4
├─02、Cytoscape clueGO进行富集分析和网络可视化.mp4
├─03、Cytoscape理论和pathway-510.mp4
├─25-Cytoscape绘制网路通路图(1).pdf
├─25-Cytoscape绘制网路通路图.pdf
├─cytoscape演示数据.zip
├─KEGG.zip
(8)\08、GSEA富集分析理论和可视化案例讲解
├─01、GSEA富集分析理论和可视化案例讲解(GO、KEGG、MsigDB).mp4
├─02、GSEA两组样品和时间序列富集分析.mp4
├─03、GSEA理论-510.mp4
├─04、GSEA实战-510.mp4
├─15_GSEA.zip
(9)\09、二代和三代高通量测序原理
├─01、二代和三代高通量测序原理.mp4
├─02、中心法则测序应用-510.mp4
├─03、测序原理-510.mp4
├─21-二代测序平台和原理(1).pdf
├─21-二代测序平台和原理.pdf
(10)\10、转录组STAR比对分析流程讲解
├─01、转录组STAR比对分析流程讲解.mp4
├─02、STAR有参操作解释-510.mp4
├─03、STAR有参操作总结-510.mp4
├─22-转录分析流程STAR(1).pdf
├─22-转录分析流程STAR.pdf
(11)\11、转录组STAR比对分析实战与IGV可视化、比对评估、饱和性检测
├─01、转录组STAR比对分析实战和IGV可视化 比对评估 饱和性检测.mp4
├─02、IGV可视化-510.mp4
├─23-转录组分析流程-IGV(1).pdf
├─23-转录组分析流程-IGV.pdf
(12)\12、STAR定量结果差异基因分析和与Salmon结果比较
├─01、STAR定量结果差异基因分析和与salmon结果比较.mp4
├─23_star_deseq2_go.zip
(13)\13、WGCNA理论分析和注意事项、案例解读
├─01、WGCNA理论-510.mp4
├─02、WGCNA理论分析和注意事项、案例解读.mp4
├─24-WGCNA共表达网络分析(1).pdf
├─24-WGCNA共表达网络分析.pdf
(14)\14、WGCNA共表达实战
├─01、WGCNA实战和网络可视化-510.mp4
├─02、WGCNA共表达实战.mp4
├─24_WGCNA.zip
(15)\15、转录组组装和可变剪接分析理论和实战
├─01、转录组组装和可变剪接分析理论和实战.mp4
├─31-转录本拼装和可变剪接.pdf
(16)\16、无参转录组分析理论
├─01、无参转录组分析理论.mp4
├─32-无参转录组组装和注释.pdf
(17)\17、单细胞转录组概念
├─01、单细胞转录组概念.mp4
├─31-单细胞转录组基本概念.pdf
(18)\18、单细胞转录组实战
├─01、10X拆库浏览.mp4
├─02、单细胞转录组数据获取-510.mp4
├─03、seurat-monocle-scater包解释和运行.mp4
├─32-单细胞转录组实战.pdf
├─33-单细胞转录组数据获取.pdf
(19)\19、PCA、TSNE、单细胞理论和操作
├─01、PCA TSNE理论.mp4
├─02、PCA TSNE单细胞操作.mp4
├─34-PCA和单细胞可视化.pdf
├─PCA_scRNA.zip
(20)\20、常用转录组资源数据库简介
├─01、常用转录组资源数据库简介.mp4
├─33-转录组案例分析和基因表达资源数据库.pdf
(21)\21、常见图形解读
├─01、常见图形解读.mp4
├─02、常见图形解释-510.mp4
├─26-转录组常用图形解读(1).pdf
├─26-转录组常用图形解读.pdf
(22)\22、AdobeIllustrator修图和拼图
├─01、AdobeIllustrator修图和拼图.mp4
├─36_AI.zip
├─36论文图表.pdf
(23)\23、Linux基础(一)晚间额外课
├─01、Linux基础 (一)晚间额外课.mp4
├─Linux基础.zip
├─linux简介与实操.pdf
(24)\24、Linux基础(二)晚间额外课
├─01、Linux基础(二)晚间额外课.mp4
(25)\25、Excel便捷操作
├─01、excel操作-510.mp4
├─Excel.190511.pptx
(26)\26、发表文章相关知识
├─01、发表文章-510.mp4
├─35_发表前准备.pdf
(27)\27、两周后的答疑
├─01、两周后的答疑.mp4

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